Prirodni smjer namijenjen je učenicima koje zanima svijet prirodnih nauka, istraživanje i razumijevanje zakonitosti koje upravljaju prirodom i društvom. Nastavni plan i program usmjeren je na dublje proučavanje biologije, hemije, fizike i matematike, uz razvoj analitičkog mišljenja i naučnog pristupa rješavanju problema.

Poseban naglasak stavlja se na STEM područje (nauka, tehnologija, inženjerstvo i matematika), kroz koje učenici uče povezivati teorijska znanja s praktičnim radom. Kroz eksperimente, projekte, istraživačke zadatke i timski rad, učenici razvijaju radoznalost, preciznost i sposobnost samostalnog zaključivanja.

Prirodni smjer potiče učenike na istraživanje, inovativnost i kritičko razmišljanje, te ih kvalitetno priprema za nastavak obrazovanja na fakultetima iz oblasti medicine, farmacije, prirodnih i tehničkih nauka, kao i drugih STEM disciplina.

Kroz nastavu i vannastavne aktivnosti, učenici imaju priliku učestvovati u projektima, takmičenjima i naučnim inicijativama, čime dodatno razvijaju svoje interese i talente. Ovaj smjer je idealan za učenike koji vole eksperimentisati, postavljati pitanja i tražiti odgovore, te žele graditi budućnost zasnovanu na znanju i nauci.